为您整理《名侦探柯南》第四部剧场版《瞳孔中的暗杀者》（名探偵コナン 漆黒の組織と黒の組織）的剧情介绍：
剧情简介：
事件的开端，是在大阪国际和平会议（ICPC）即将召开之际，与会议相关的世界著名化妆品公司总裁 神户典子（Kobe典子） 在返回酒店途中遭到神秘狙击手袭击，身受重伤。
柯南（新一）和毛利兰因为与目暮警官等人有约，恰好在附近，目暮警官将他们带到了现场附近进行调查。柯南敏锐地观察现场，发现了一些不寻常的线索，并意识到这起事件绝非偶然，背后可能隐藏着巨大的阴谋。
通过细致的推理和线索收集，柯南逐渐将线索指向了与神户典子公司有竞争关系的另一家公司——黑衣组织。他发现神户典子研究的某种特殊化妆品成分，似乎与黑衣组织的神秘药物“APTX 4869”（即后来导致新一变小并化名柯南的毒药）有关，甚至可能与之有相似或关联的效果。
随着调查的深入，柯南和他的朋友们发现，黑衣组织不仅想要窃取神户典子的研究成果，甚至可能想要利用她来获取更重要的情报，或者将其作为人质/替罪羊。组织内部的成员，如 琴酒（Gin）、伏特加（Vodka）、贝尔摩德（Vermouth） 等人，都成为了柯南需要提防和追踪的目标。
与此同时，柯南发现了一个名叫 “雪莉”（Sherry） 的神秘少女，她似乎对黑衣组织内部的情况有所了解，并且似乎与组织内部的某个高层人物（被戏称为“雪莉姐姐”）有着联系。柯南试图接近雪莉，希望能够从她那里获得更多关于黑衣组织内部结构和目的的信息。
剧情的高潮部分，是在东京的某处地点（根据不同版本或改编，地点可能略有差异，常见版本设定在机场附近），组织再次对神户典子以及柯南等人发动了更为激烈的袭击。一场惊心动魄的追逐战和枪战就此展开。柯南在兰、园子、光彦等人的帮助下，利用智慧和身手，不断躲避组织的追杀，并试图找出幕后主使。
最终，经过一系列曲折的推理和搏斗，柯南在关键时刻，通过某种方式（例如利用现场的特定条件或雪莉提供的关键信息），让组织内部的矛盾或失误暴露出来，成功挫败了组织的暗杀计划，暂时救出了神户典子。
然而，黑衣组织并未被彻底消灭，其核心成员依然潜伏在暗处，柯南的冒险也远未结束。这次事件不仅让柯南更加了解了黑衣组织的部分运作方式，也让他意识到保护重要人物（如灰原哀/宫野志保）和揭露组织真相的紧迫性。
总结：
《瞳孔中的暗杀者》是《名侦探柯南》系列中非常经典的一部剧场版。它不仅展现了柯南与黑衣组织之间惊险刺激的对抗，也进一步揭示了黑衣组织内部的复杂关系和部分成员的背景。对“雪莉”这个角色的初步接触和神户典子与APTX 4869之间可能的联系，都为后续的剧情发展埋下了重要的伏笔。这部电影将推理、动作、情感元素结合得相当出色，是许多粉丝心中的必看之作。
